十九世紀末，石屋的位置上建有兩排屋宇，由何氏家族擁有，住有三數戶人家。
日治期間，日軍為擴建啟德機場而拆卸了多條九龍城的村落。其後，日軍在聯合道一帶的土地上興建平房以安置無家可歸的村民。
戰後，大量內地移民移居香港，石屋一帶成為寮屋區。這片寮屋區被稱為侯王廟新村、荔枝園和何家園。從1945年及1949年的航空照片可見一列五間的石屋在何家村的位置上落成。寮屋區內開設了多間片場，包括世光片場、友僑片場及長城電影製片有限公司。隨著香港工業日漸發展，在六七十年代，石屋一帶出現了不少山寨廠及工場。31號石屋亦被用作「藍恩記山墳墓碑工程公司」，「藍恩記」招牌仍保留至今。
為了配合九龍城的市區發展計劃，寮屋區在2001年全面清拆，僅遺下現存的石屋。
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石屋是一幢由五個單位組成的中式村屋，五個單位並列，樓高兩層，以花崗石及混凝土築建而成。石砌的牆身及混凝土橫樑承托著木結構樓板，以及由木椽、桁樑和瓦片構成的金字形屋頂。屋頂以中式筒瓦和板瓦鋪設而成。後方則建有廚房和廁所。石屋的門戶均為中式設計，上有木鎖和石插孔。
31號石屋為「藍恩記山墳墓碑工程公司」的舊址，現存該公司的招牌為石屋一項重要特色。此招牌為八十年代「藍恩記」開業後才加添的，反映了石屋歷史的變遷。為了配合墓碑廠，31號石屋窗戶的復修亦選用了同一年代的鐵窗。
石屋顧名思義是由石砌而成的，在復修的過程中，麻石牆上的後加批盪被清除，並以合乎現代規格的灰泥修補石縫。
於復修前，石屋原有的中式屋頂被後加的波紋形狀坑鐵板所覆蓋，這些坑鐵板在復修的過程中被移除，為了符合現時的安全及防火規定，整個屋頂亦被拆除重新鋪砌，以重現昔日傳統中式金字形屋頂。
石屋家園計劃旨在恢復石屋舊貌、活化「何家村」舊址，彰顯石屋在九龍城區的歷史價值及重要性，讓新一代在活化的歷史建築內承傳上一代重視的文化及價值。
修復32號單位原有的廚房及煙囪，配以昔日傢俱和用品供訪客體會昔日石屋的生活。
冰室的餐飲服務和桌上遊戲既讓訪客置身於歷史場境內，亦可加強青少年的交流；而冰室所提供的就業和實習機會更可以發揮青少年所長，以及建立他們正確的生命價值觀。
石屋家園屋外的地面圖案以1964年航空照片的觀察作為設計藍本，成為現今九龍城區唯一開放予公眾之明陣，為市民提供一個獨一無二的靜修空間。